薄膜过滤法微生物限度检查纯化水的操作流程如下：

　　准备工作：将滤杯清洗洁净并晾干。取滤膜(50mm)用纯化水浸泡3~5分钟。滤杯及滤膜支撑网需消毒备用，可以采用火焰灭菌器进行快速消毒。

　　过滤：将滤膜放在抽滤设备的滤网上，然后将纯化水注入微生物限度检测仪过滤杯内。启动真空泵，并打开相应的阀门，实施过滤集菌。当过滤结束后(即滤膜上没有水珠)，关闭真空泵开关，用无菌镊子取出滤膜。

　　培养：将滤膜平贴在准备好的培养基上，确保菌面朝上，且不得有气泡。接着，注入适量的液体培养基，使其覆盖滤膜表面。之后，将培养基放置在生化培育箱或恒温培育箱中，按照规定的温度和时间进行培养。每天需要检查并计数。

　　在操作过程中，需要注意保持无菌环境，以防止对样品和环境造成污染。同时，稀释倍数应根据样品的污染程度进行调整，并且需要通过验证来确定合适的稀释倍数。

　　另外，为了确保设备的正常运行和实验结果的准确性，仪器在长时间未使用后再次使用前，应对管路进行消毒。可以选择使用乙醇、新洁尔灭、甲醛或次氯酸溶液等消毒剂。

　　完成以上步骤后，就可以通过薄膜过滤法完成微生物限度检查纯化水的操作了。如有需要，可以查阅相关实验手册或咨询专业实验人员，获取更详细的信息。